所有类型的脓疱型银屑病的组织学特征均相似，早改变见于真皮，出现血管扩张及血管周围淋巴细胞浸润，24小时内表皮水肿，乳头内毛细血管周围的中性粒细胞开始向上方表皮移入、聚集、形成海绵状脓疱，随着皮损的成熟，脓疱中央的表皮细胞发生溶解，同时脓疱增多，终随表皮向上移动，成为角质层下脓疱，特点是海绵状脓疱较大，其内主要是中性白细胞。
此外，典型的斑块型银屑病的组织学特征也见于脓疱型银屑病，包括角化不全、皮突延长、真皮乳头血管周围出现淋巴细胞或混合型炎细胞浸润。因脓疱形成快，表皮常无充足时间发展到寻常型银屑病那样厚。
掌跖脓疱型银屑病的掌跖部皮损很早即有海绵状脓疱形成，真皮乳头顶部血管内的淋巴细胞移入到表皮下部。初期表皮内含有淋巴细胞聚集的水疱，随着水疱的增大，终发生为大的单房性表皮内脓疱，疱腔内可见大量中性粒细胞;脓疱周围的表皮也有小的海绵状脓疱，邻近脓疱的表皮常有角化过度及棘层肥厚。
